AT5G49770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway, protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: sperm cell, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT5G49760.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:20222860..20227267 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 104529.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 946 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKMSSRIGLF KLLILLFFQI YSVYAFTDGS DFTALQALKN EWDTLSKSWK SSDPCGTEWV GITCNNDNRV VSISLTNRNL KGKLPTEIST LSELQTLDLT 101: GNPELSGPLP ANIGNLRKLT FLSLMGCAFN GPIPDSIGNL EQLTRLSLNL NKFSGTIPAS MGRLSKLYWF DIADNQLEGK LPVSDGASLP GLDMLLQTGH 201: FHFGNNKLSG EIPEKLFSSE MTLLHVLFDG NQFTGSIPES LGLVQNLTVL RLDRNRLSGD IPSSLNNLTN LQELHLSDNK FTGSLPNLTS LTSLYTLDVS 301: NNPLALSPVP SWIPFLNSLS TLRLEDIQLD GPVPTSLFSP LQLQTVSLKH NLINTTLDLG TNYSKQLDFV DLRDNFITGY KSPANNPVNV MLADNQVCQD 401: PANQLSGYCN AVQPNSTFST LTKCGNHCGK GKEPNQGCHC VYPLTGVFTL RSPSFSGFSN NSNFLKFGES LMTFFKNGKY PVDSVAMRNI SENPTDYHLL 501: INLLIFPSGR DRFNQTEMDS INSAFTIQDY KPPPRFGPYI FVADQYKTFS DLEDSKTVSM KVIIGVVVGV VVLLLLLALA GIYALRQKKR AQRATDQMNP 601: FAKWDAGKNE MDAPQLMGTK AFTFEELSKC TNNFSDANDV GGGGYGQVYK GTLPNGQVIA IKRAQQGSMQ GAFEFKTEIE LLSRVHHKNV VKLLGFCFDQ 701: KEQMLVYEYI PNGSLRDGLS GKNGVKLDWT RRLKIALGSG KGLAYLHELA DPPIIHRDVK SNNILLDEHL TAKVADFGLS KLVGDPEKAH VTTQVKGTMG 801: YLDPEYYMTN QLTEKSDVYG FGVVMLELLT GKSPIDRGSY VVKEVKKKMD KSRNLYDLQE LLDTTIIQNS GNLKGFEKYV DVALQCVEPE GVNRPTMSEV 901: VQELESILRL VGLNPNADSA TYEEASGDPY GRDSFEYTGV FPTPKP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)