AT4G28650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.988 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway, protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: hypocotyl, root, guard cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein (TAIR:AT1G08590.1); Has 236312 Blast hits to 142770 proteins in 4269 species: Archae - 150; Bacteria - 21752; Metazoa - 75925; Fungi - 11533; Plants - 97988; Viruses - 432; Other Eukaryotes - 28532 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14144155..14147276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 110484.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1013 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MKMKIIVLFL YYCYIGSTSS VLASIDNVNE LSVLLSVKST LVDPLNFLKD WKLSDTSDHC NWTGVRCNSN GNVEKLDLAG MNLTGKISDS ISQLSSLVSF 0101: NISCNGFESL LPKSIPPLKS IDISQNSFSG SLFLFSNESL GLVHLNASGN NLSGNLTEDL GNLVSLEVLD LRGNFFQGSL PSSFKNLQKL RFLGLSGNNL 0201: TGELPSVLGQ LPSLETAILG YNEFKGPIPP EFGNINSLKY LDLAIGKLSG EIPSELGKLK SLETLLLYEN NFTGTIPREI GSITTLKVLD FSDNALTGEI 0301: PMEITKLKNL QLLNLMRNKL SGSIPPAISS LAQLQVLELW NNTLSGELPS DLGKNSPLQW LDVSSNSFSG EIPSTLCNKG NLTKLILFNN TFTGQIPATL 0401: STCQSLVRVR MQNNLLNGSI PIGFGKLEKL QRLELAGNRL SGGIPGDISD SVSLSFIDFS RNQIRSSLPS TILSIHNLQA FLVADNFISG EVPDQFQDCP 0501: SLSNLDLSSN TLTGTIPSSI ASCEKLVSLN LRNNNLTGEI PRQITTMSAL AVLDLSNNSL TGVLPESIGT SPALELLNVS YNKLTGPVPI NGFLKTINPD 0601: DLRGNSGLCG GVLPPCSKFQ RATSSHSSLH GKRIVAGWLI GIASVLALGI LTIVTRTLYK KWYSNGFCGD ETASKGEWPW RLMAFHRLGF TASDILACIK 0701: ESNMIGMGAT GIVYKAEMSR SSTVLAVKKL WRSAADIEDG TTGDFVGEVN LLGKLRHRNI VRLLGFLYND KNMMIVYEFM LNGNLGDAIH GKNAAGRLLV 0801: DWVSRYNIAL GVAHGLAYLH HDCHPPVIHR DIKSNNILLD ANLDARIADF GLARMMARKK ETVSMVAGSY GYIAPEYGYT LKVDEKIDIY SYGVVLLELL 0901: TGRRPLEPEF GESVDIVEWV RRKIRDNISL EEALDPNVGN CRYVQEEMLL VLQIALLCTT KLPKDRPSMR DVISMLGEAK PRRKSNSNEE NTSRSLAEKH 1001: SSVFSTSPVN GLL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)