AT5G51160.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.732 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ankyrin repeat family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ankyrin repeat family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ankyrin repeat-containing domain (InterPro:IPR020683), Ankyrin repeat (InterPro:IPR002110); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ankyrin repeat family protein (TAIR:AT4G10720.1); Has 23468 Blast hits to 11643 proteins in 579 species: Archae - 38; Bacteria - 1696; Metazoa - 12874; Fungi - 1168; Plants - 2550; Viruses - 45; Other Eukaryotes - 5097 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:20792280..20793681 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48867.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 442 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDAFETHLPK EIVSDPLYNS FNPRSEEYVV AGKILRQRSV FDLDKNGFSP LHAAAAAGQV ETVRATLGVE KKLCRLKDRD GKTPLHVATM RGKIDVIREI 101: VASCVDCLED ETVQGQTALH LAVLHLEIEA VIAIVELITE TNRFDVLNKK DEQGNTALHL ATWRKNRQVI EVLVQAIPEE SRSFEVNAMN KMGLSAMDLL 201: VMFPSEAGDR EIYEKLIEAG AQRGRDIGTT NVERTTSTST CQERTMKSQS HKELVKYFTF KKHRDSPSEA RSALLVVASL VATATFQASL TPPGGTWQDS 301: SIPAVSQNTT NVNTTNQQAH TAGQSIMGTF NGVAFTLFVF FNTIGFSVSL SMLNILTLGF PLRFQLQICM IAMYFSHNTT MASIAPDHVK LYCILITSIL 401: AATTPGLMRL LENPIGMLAH FLDSRSQKIC SMISLSCKRF VT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)