AT1G18860.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY DNA-binding protein 61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of WRKY Transcription Factor; Group II-b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY DNA-binding protein 61 (WRKY61); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY DNA-binding protein 72 (TAIR:AT5G15130.1); Has 5252 Blast hits to 3559 proteins in 289 species: Archae - 0; Bacteria - 31; Metazoa - 146; Fungi - 97; Plants - 3463; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 1514 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6509494..6511209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52917.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 480 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDEAKEENRR LKSSLSKIKK DFDILQTQYN QLMAKHNEPT KFQSKGHHQD KGEDEDREKV NEREELVSLS LGRRLNSEVP SGSNKEEKNK DVEEAEGDRN 101: YDDNEKSSIQ GLSMGIEYKA LSNPNEKLEI DHNQETMSLE ISNNNKIRSQ NSFGFKNDGD DHEDEDEILP QNLVKKTRVS VRSRCETPTM NDGCQWRKYG 201: QKIAKGNPCP RAYYRCTIAA SCPVRKQVQR CSEDMSILIS TYEGTHNHPL PMSATAMASA TSAAASMLLS GASSSSSAAA DLHGLNFSLS GNNITPKPKT 301: HFLQSPSSSG HPTVTLDLTT SSSSQQPFLS MLNRFSSPPS NVSRSNSYPS TNLNFSNNTN TLMNWGGGGN PSDQYRAAYG NINTHQQSPY HKIIQTRTAG 401: SSFDPFGRSS SSHSPQINLD HIGIKNIISH QVPSLPAETI KAITTDPSFQ SALATALSSI MGGDLKIDHN VTRNEAEKSP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)