AT5G15130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY DNA-binding protein 72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of WRKY Transcription Factor; Group II-b; contribute to basal immunity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY DNA-binding protein 72 (WRKY72); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY DNA-binding protein 61 (TAIR:AT1G18860.1); Has 6758 Blast hits to 4151 proteins in 378 species: Archae - 0; Bacteria - 669; Metazoa - 395; Fungi - 387; Plants - 3478; Viruses - 9; Other Eukaryotes - 1820 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:4904426..4906879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59010.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 548 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEVLLKLPSS ESPLKDKFGS VQIHEANKGD GDHQELESAK AEMSEVKEEN EKLKGMLERI ESDYKSLKLR FFDIIQQEPS NTATKNQNMV DHPKPTTTDL 101: SSFDQERELV SLSLGRRSSS PSDSVPKKEE KTDAISAEVN ADEELTKAGL TLGINNGNGG EPKEGLSMEN RANSGSEEAW APGKVTGKRS SPAPASGGDA 201: DGEAGQQNHV KRARVCVRAR CDTPTMNDGC QWRKYGQKIA KGNPCPRAYY RCTVAPGCPV RKQVQRCADD MSILITTYEG THSHSLPLSA TTMASTTSAA 301: ASMLLSGSSS SPAAEMIGNN LYDNSRFNNN NKSFYSPTLH SPLHPTVTLD LTAPQHSSSS SSSLLSLNFN KFSNSFQRFP STSLNFSSTS STSSNPSTLN 401: LPAIWGNGYS SYTPYPYNNV QFGTSNLGKT VQNSQSLTET LTKALTSDPS FHSVIAAAIS TMVGSNGEQQ IVGPRHSISN NIQQTNTTNN NKGCGGYFSS 501: LLMSNIMASN QTGASLDQPS SQLPPFSMFK NSSSSSSTTN FVNKEEKS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)