AT1G68150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY DNA-binding protein 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of WRKY Transcription Factor; Group II-b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY DNA-binding protein 9 (WRKY9); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY DNA-binding protein 72 (TAIR:AT5G15130.1); Has 6485 Blast hits to 5077 proteins in 398 species: Archae - 3; Bacteria - 121; Metazoa - 1108; Fungi - 186; Plants - 3539; Viruses - 39; Other Eukaryotes - 1489 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:25543970..25545615 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42745.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 374 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGFDFSTSKS KAKRQKRIEV RFASPLMGID LSLKLEAEEK KKEIEGSKHS RENKEDEEHD ASGDEDEQMV KEDEDDSSSL GLRTREEENE REELLQLQIQ 101: MESVKEENTR LRKLVEQTLE DYRHLEMKFP VIDKTKKMDL EMFLGVQGKR CVDITSKARK RGAERSPSME REIGLSLSLE KKQKQEESKE AVQSHHQRYN 201: SSSLDMNMPR IISSSQGNRK ARVSVRARCE TATMNDGCQW RKYGQKTAKG NPCPRAYYRC TVAPGCPVRK QVQRCLEDMS ILITTYEGTH NHPLPVGATA 301: MASTASTSPF LLLDSSDNLS HPSYYQTPQA IDSSLITYPQ NSSYNNRTIR SLNFDGPSRG DHVSSSQNRL NWMM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)