AT1G69810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY DNA-binding protein 36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of WRKY Transcription Factor; Group II-b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY DNA-binding protein 36 (WRKY36); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY family transcription factor (TAIR:AT4G04450.1); Has 3417 Blast hits to 2974 proteins in 232 species: Archae - 0; Bacteria - 11; Metazoa - 46; Fungi - 17; Plants - 3258; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 85 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26277238..26279116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43352.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 387 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIKEETVSYF QTFDGVMAES DKEEELDATK AKVEKVREEN EKLKLLLSTI LNNYNSLQMQ VSKVLGQQQG ASSMELDHID RQDENNDYDV DISLRLGRSE 101: QKISKKEENK VDKISTKNVE ESKDKRSALG FGFQIQSYEA SKLDDLCRQV KLANAENKCV SSRKDVKSVR NENHQDVLEE HEQTGLKKTR VCVKASCEDP 201: SINDGCQWRK YGQKTAKTNP LPRAYYRCSM SSNCPVRKQV QRCGEEETSA FMTTYEGNHD HPLPMEASHM AAGTSAAASL LQSGSSSSSS STSASLSYFF 301: PFHHFSISTT NSHPTVTLDL TRPNYPNQLP DDYPLSSSSF SLNFSSPDPP PPSSHDHTLN FSGLRTQAPL STDSLLARYR TRLSGQQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)