AT3G02130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : receptor-like protein kinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
receptor-like protein kinase 2 (RPK2); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: lignin metabolic process, protein amino acid phosphorylation, transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway, pollen maturation, anther dehiscence; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: receptor-like protein kinase 1 (TAIR:AT1G69270.1); Has 212351 Blast hits to 140653 proteins in 4689 species: Archae - 161; Bacteria - 19257; Metazoa - 62611; Fungi - 11388; Plants - 92974; Viruses - 608; Other Eukaryotes - 25352 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:380726..384181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 125237.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1151 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MTSLPSSVIK WRFFRRQMPS DVVFSLCLLC FASCLAGKIT VLADSDKSVL LRFKKTVSDP GSILASWVEE SEDYCSWFGV SCDSSSRVMA LNISGSGSSE 0101: ISRNRFTCGD IGKFPLYGFG VRRDCTGNHG ALAGNLPSVI MSLTGLRVLS LPFNSFSGEI PVGIWGMEKL EVLDLEGNLM TGSLPDQFTG LRNLRVMNLG 0201: FNRVSGEIPN SLQNLTKLEI LNLGGNKLNG TVPGFVGRFR VLHLPLNWLQ GSLPKDIGDS CGKLEHLDLS GNFLTGRIPE SLGKCAGLRS LLLYMNTLEE 0301: TIPLEFGSLQ KLEVLDVSRN TLSGPLPVEL GNCSSLSVLV LSNLYNVYED INSVRGEADL PPGADLTSMT EDFNFYQGGI PEEITRLPKL KILWVPRATL 0401: EGRFPGDWGS CQNLEMVNLG QNFFKGEIPV GLSKCKNLRL LDLSSNRLTG ELLKEISVPC MSVFDVGGNS LSGVIPDFLN NTTSHCPPVV YFDRFSIESY 0501: SDPSSVYLSF FTEKAQVGTS LIDLGSDGGP AVFHNFADNN FTGTLKSIPL AQERLGKRVS YIFSAGGNRL YGQFPGNLFD NCDELKAVYV NVSFNKLSGR 0601: IPQGLNNMCT SLKILDASVN QIFGPIPTSL GDLASLVALN LSWNQLQGQI PGSLGKKMAA LTYLSIANNN LTGQIPQSFG QLHSLDVLDL SSNHLSGGIP 0701: HDFVNLKNLT VLLLNNNNLS GPIPSGFATF AVFNVSSNNL SGPVPSTNGL TKCSTVSGNP YLRPCHVFSL TTPSSDSRDS TGDSITQDYA SSPVENAPSQ 0801: SPGKGGFNSL EIASIASASA IVSVLIALVI LFFYTRKWHP KSKIMATTKR EVTMFMDIGV PITFDNVVRA TGNFNASNLI GNGGFGATYK AEISQDVVVA 0901: IKRLSIGRFQ GVQQFHAEIK TLGRLRHPNL VTLIGYHASE TEMFLVYNYL PGGNLEKFIQ ERSTRDWRVL HKIALDIARA LAYLHDQCVP RVLHRDVKPS 1001: NILLDDDCNA YLSDFGLARL LGTSETHATT GVAGTFGYVA PEYAMTCRVS DKADVYSYGV VLLELLSDKK ALDPSFVSYG NGFNIVQWAC MLLRQGRAKE 1101: FFTAGLWDAG PHDDLVEVLH LAVVCTVDSL STRPTMKQVV RRLKQLQPPS C |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)