AT3G53130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome P450 superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Lutein-deficient 1 (LUT1) required for lutein biosynthesis, member of the xanthophyll class of carotenoids. Involved in epsilon ring hydroxylation. Maps at 67.3 cM on chromosome 3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
LUTEIN DEFICIENT 1 (LUT1); FUNCTIONS IN: epsilon hydroxylase activity, oxygen binding; INVOLVED IN: carotenoid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 97, subfamily A, polypeptide 3 (TAIR:AT1G31800.1); Has 31038 Blast hits to 30928 proteins in 1581 species: Archae - 62; Bacteria - 3557; Metazoa - 11361; Fungi - 6359; Plants - 8451; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1245 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19692812..19695278 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60558.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 539 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESSLFSPSS SSYSSLFTAK PTRLLSPKPK FTFSIRSSIE KPKPKLETNS SKSQSWVSPD WLTTLTRTLS SGKNDESGIP IANAKLDDVA DLLGGALFLP 101: LYKWMNEYGP IYRLAAGPRN FVIVSDPAIA KHVLRNYPKY AKGLVAEVSE FLFGSGFAIA EGPLWTARRR AVVPSLHRRY LSVIVERVFC KCAERLVEKL 201: QPYAEDGSAV NMEAKFSQMT LDVIGLSLFN YNFDSLTTDS PVIEAVYTAL KEAELRSTDL LPYWKIDALC KIVPRQVKAE KAVTLIRETV EDLIAKCKEI 301: VEREGERIND EEYVNDADPS ILRFLLASRE EVSSVQLRDD LLSMLVAGHE TTGSVLTWTL YLLSKNSSAL RKAQEEVDRV LEGRNPAFED IKELKYITRC 401: INESMRLYPH PPVLIRRAQV PDILPGNYKV NTGQDIMISV YNIHRSSEVW EKAEEFLPER FDIDGAIPNE TNTDFKFIPF SGGPRKCVGD QFALMEAIVA 501: LAVFLQRLNV ELVPDQTISM TTGATIHTTN GLYMKVSQR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)