AT5G51910.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : TCP family transcription factor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
TCP family transcription factor ; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Transcription factor, TCP (InterPro:IPR005333), Transcription factor TCP subgroup (InterPro:IPR017887); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: TCP family transcription factor (TAIR:AT2G45680.1); Has 731 Blast hits to 731 proteins in 79 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 731; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:21094704..21095585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31462.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 293 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESNHEGNAI QVIDQVTTMT HLSDPNPKTK PGMMLMKQED GYLQPVKTKP APKRPTSKDR HTKVEGRGRR IRMPAGCAAR VFQLTRELGH KSDGETIRWL 101: LERAEPAIIE ATGTGTVPAI AVSVNGTLKI PTSSPVLNDG GRDGDGDLIK KRRKRNCTSD FVDVNDSCHS SVTSGLAPIT ASNYGVNILN VNTQGFVPFW 201: PMGMGTAFVT GGPDQMGQMW AIPTVATAPF LNVGARPVSS YVSNASDAEA EMETSGGGTT QPLRDFSLEI YDKRELQFLG GSGNSSPSSC HET |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)