AT5G45870.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PYR1-like 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the PYR (pyrabactin resistance )/PYL(PYR1-like)/RCAR (regulatory components of ABA receptor) family proteins with 14 members. PYR/PYL/RCAR family proteins function as abscisic acid sensors. Mediate ABA-dependent regulation of protein phosphatase 2Cs ABI1 and ABI2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PYR1-like 12 (PYL12); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Polyketide cyclase/dehydrase (InterPro:IPR019587); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PYR1-like 11 (TAIR:AT5G45860.1); Has 430 Blast hits to 430 proteins in 36 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 0; Fungi - 2; Plants - 426; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:18606564..18607043 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17634.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 159 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKTSQEQHVC GSTVVQTINA PLPLVWSILR RFDNPKTFKH FVKTCKLRSG DGGEGSVREV TVVSDLPASF SLERLDELDD ESHVMVISII GGDHRLVNYQ 101: SKTTVFVAAE EEKTVVVESY VVDVPEGNTE EETTLFADTI VGCNLRSLAK LSEKMMELT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)