AT1G72770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homology to ABI1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
mutant has ABA hypersensitive inhibition of seed germination; Protein Phosphatase 2C; regulates the activation of the Snf1-related kinase OST1 by abscisic acid. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
homology to ABI1 (HAB1); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity; INVOLVED IN: protein amino acid dephosphorylation; LOCATED IN: protein serine/threonine phosphatase complex; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein phosphatase 2C, manganese/magnesium aspartate binding site (InterPro:IPR000222), Protein phosphatase 2C-related (InterPro:IPR001932), Protein phosphatase 2C, N-terminal (InterPro:IPR014045), Protein phosphatase 2C (InterPro:IPR015655); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: homology to ABI2 (TAIR:AT1G17550.1); Has 6788 Blast hits to 6778 proteins in 499 species: Archae - 4; Bacteria - 382; Metazoa - 1655; Fungi - 745; Plants - 2728; Viruses - 7; Other Eukaryotes - 1267 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27390998..27392851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55747.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 511 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEEMTPAVAM TLSLAANTMC ESSPVEITQL KNVTDAADLL SDSENQSFCN GGTECTMEDV SELEEVGEQD LLKTLSDTRS GSSNVFDEDD VLSVVEDNSA 101: VISEGLLVVD AGSELSLSNT AMEIDNGRVL ATAIIVGESS IEQVPTAEVL IAGVNQDTNT SEVVIRLPDE NSNHLVKGRS VYELDCIPLW GTVSIQGNRS 201: EMEDAFAVSP HFLKLPIKML MGDHEGMSPS LTHLTGHFFG VYDGHGGHKV ADYCRDRLHF ALAEEIERIK DELCKRNTGE GRQVQWDKVF TSCFLTVDGE 301: IEGKIGRAVV GSSDKVLEAV ASETVGSTAV VALVCSSHIV VSNCGDSRAV LFRGKEAMPL SVDHKPDRED EYARIENAGG KVIQWQGARV FGVLAMSRSI 401: GDRYLKPYVI PEPEVTFMPR SREDECLILA SDGLWDVMNN QEVCEIARRR ILMWHKKNGA PPLAERGKGI DPACQAAADY LSMLALQKGS KDNISIIVID 501: LKAQRKFKTR T |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)