AT4G18620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PYR1-like 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the PYR (pyrabactin resistance )/PYL(PYR1-like)/RCAR (regulatory components of ABA receptor) family proteins with 14 members. PYR/PYL/RCAR family proteins function as abscisic acid sensors. Mediate ABA-dependent regulation of protein phosphatase 2Cs ABI1 and ABI2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PYR1-like 13 (PYL13); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Polyketide cyclase/dehydrase (InterPro:IPR019587); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PYR1-like 12 (TAIR:AT5G45870.1); Has 403 Blast hits to 403 proteins in 30 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 13; Fungi - 2; Plants - 388; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:10254359..10254853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18127.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 164 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESSKQKRCR SSVVETIEAP LPLVWSILRS FDKPQAYQRF VKSCTMRSGG GGGKGGEGKG SVRDVTLVSG FPADFSTERL EELDDESHVM VVSIIGGNHR 101: LVNYKSKTKV VASPEDMAKK TVVVESYVVD VPEGTSEEDT IFFVDNIIRY NLTSLAKLTK KMMK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)