AT2G17450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RING-H2 finger A3A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative RING-H2 finger protein RHA3a. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
RING-H2 finger A3A (RHA3A); FUNCTIONS IN: zinc ion binding; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, RING-type (InterPro:IPR001841), Zinc finger, C3HC4 RING-type (InterPro:IPR018957); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RING-H2 finger A3B (TAIR:AT4G35480.1); Has 9845 Blast hits to 9818 proteins in 280 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2501; Fungi - 735; Plants - 5213; Viruses - 41; Other Eukaryotes - 1355 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:7576640..7577197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19937.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 185 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTRPSRLLET AAPPPQPSEE MIAAESDMVV ILSALLCALI CVAGLAAVVR CAWLRRFTAG GDSPSPNKGL KKKALQSLPR STFTAAESTS GAAAEEGDST 101: ECAICLTDFA DGEEIRVLPL CGHSFHVECI DKWLVSRSSC PSCRRILTPV RCDRCGHAST AEMKDQAHRH QHHQHSSTTI PTFLP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)