AT4G16620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.832 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF6, transmembrane (InterPro:IPR000620); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein (TAIR:AT5G47470.1); Has 2049 Blast hits to 2044 proteins in 373 species: Archae - 4; Bacteria - 835; Metazoa - 2; Fungi - 3; Plants - 1166; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 39 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:9358185..9359871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38313.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 359 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMKRETLIEA GIIGGLAGAQ VIYAGNSELL SQLLSLGIDP LLIVILCTFA SVLLITPLAF LLERKLWPRS LSFKLKIKLV LVALAGVTLF QGLFLEGMKH 101: TSASMATAMP NLCPAFIFVI AWAAGMEKVK LSCMYSRVKM GGTVLCVMGA LIMSLMHSTT ATLSSVKTIP IVPDEVVVDK DKILGCLYLL LAICGLSSSI 201: VLQASILAEF PAPISMFSMV SLMGGITTVA LQYALKGSME MGSASVIGLG HLVGYAILGG LVSGGGLSFN AWVIKRKGPV IVSLFSPIAT VVCVVVSAFT 301: MEESFNLGSF AGMALMFGGL YFVLWAKGKE DCEEIDEMKQ DDEESLLRTE FDLQKPLLL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)