AT4G18550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
alpha/beta-Hydrolases superfamily protein; FUNCTIONS IN: triglyceride lipase activity; INVOLVED IN: lipid metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 7 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, class 3 (InterPro:IPR002921); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT1G06250.1); Has 1222 Blast hits to 1214 proteins in 260 species: Archae - 0; Bacteria - 234; Metazoa - 8; Fungi - 231; Plants - 573; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 175 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:10225006..10226862 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47794.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 419 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKRKKKEEEE EKLIVTREFA KRWRDLSGQN HWKGMLQPLD QDLREYIIHY GEMAQAGYDT FNINTESQFA GASIYSRKDF FAKVGLEIAH PYTKYKVTKF 101: IYATSDIHVP ESFLLFPISR EGWSKESNWM GYVAVTDDQG TALLGRRDIV VSWRGSVQPL EWVEDFEFGL VNAIKIFGER NDQVQIHQGW YSIYMSQDER 201: SPFTKTNARD QVLREVGRLL EKYKDEEVSI TICGHSLGAA LATLSATDIV ANGYNRPKSR PDKSCPVTAF VFASPRVGDS DFRKLFSGLE DIRVLRTRNL 301: PDVIPIYPPI GYSEVGDEFP IDTRKSPYMK SPGNLATFHC LEGYLHGVAG TQGTNKADLF RLDVERAIGL VNKSVDGLKD ECMVPGKWRV LKNKGMAQQD 401: DGSWELVDHE IDDNEDLDF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)