AT5G05170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cellulose synthase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cellulose synthase isomer. CESA3 mutants have cellulose defect in the primary cell wall. Multiple lines of evidence suggest that CESA3, along with CESA1 and CESA6 are present in the same plasma membrane complex for cellulose biosynthesis. As inferred from the null role of secondary wall-type CesAs, included in a set of five primary wall-type CesAs that may support trichome cell wall thickening. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CONSTITUTIVE EXPRESSION OF VSP 1 (CEV1); FUNCTIONS IN: cellulose synthase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: primary cell wall biogenesis, cellulose biosynthetic process, defense response; LOCATED IN: Golgi apparatus, plasma membrane; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cellulose synthase (InterPro:IPR005150), Zinc finger, RING-type (InterPro:IPR001841); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cellulose synthase 1 (TAIR:AT4G32410.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:1530401..1535090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 119689.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1065 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MESEGETAGK PMKNIVPQTC QICSDNVGKT VDGDRFVACD ICSFPVCRPC YEYERKDGNQ SCPQCKTRYK RLKGSPAIPG DKDEDGLADE GTVEFNYPQK 0101: EKISERMLGW HLTRGKGEEM GEPQYDKEVS HNHLPRLTSR QDTSGEFSAA SPERLSVSST IAGGKRLPYS SDVNQSPNRR IVDPVGLGNV AWKERVDGWK 0201: MKQEKNTGPV STQAASERGG VDIDASTDIL ADEALLNDEA RQPLSRKVSI PSSRINPYRM VIMLRLVILC LFLHYRITNP VPNAFALWLV SVICEIWFAL 0301: SWILDQFPKW FPVNRETYLD RLALRYDREG EPSQLAAVDI FVSTVDPLKE PPLVTANTVL SILAVDYPVD KVSCYVSDDG AAMLSFESLA ETSEFARKWV 0401: PFCKKYSIEP RAPEWYFAAK IDYLKDKVQT SFVKDRRAMK REYEEFKIRI NALVSKALKC PEEGWVMQDG TPWPGNNTRD HPGMIQVFLG QNGGLDAEGN 0501: ELPRLVYVSR EKRPGFQHHK KAGAMNALVR VSAVLTNGPF ILNLDCDHYI NNSKALREAM CFLMDPNLGK QVCYVQFPQR FDGIDKNDRY ANRNTVFFDI 0601: NLRGLDGIQG PVYVGTGCVF NRTALYGYEP PIKVKHKKPS LLSKLCGGSR KKNSKAKKES DKKKSGRHTD STVPVFNLDD IEEGVEGAGF DDEKALLMSQ 0701: MSLEKRFGQS AVFVASTLME NGGVPPSATP ENLLKEAIHV ISCGYEDKSD WGMEIGWIYG SVTEDILTGF KMHARGWRSI YCMPKLPAFK GSAPINLSDR 0801: LNQVLRWALG SVEILFSRHC PIWYGYNGRL KFLERFAYVN TTIYPITSIP LLMYCTLPAV CLFTNQFIIP QISNIASIWF LSLFLSIFAT GILEMRWSGV 0901: GIDEWWRNEQ FWVIGGVSAH LFAVFQGILK VLAGIDTNFT VTSKASDEDG DFAELYLFKW TTLLIPPTTL LIVNLVGVVA GVSYAINSGY QSWGPLFGKL 1001: FFAFWVIVHL YPFLKGLMGR QNRTPTIVVV WSVLLASIFS LLWVRIDPFT SRVTGPDILE CGINC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)