AT4G26770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphatidate cytidylyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phosphatidate cytidylyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: phosphatidate cytidylyltransferase activity; INVOLVED IN: phospholipid biosynthetic process; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: petal, leaf whorl, flower, pollen tube; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphatidate cytidylyltransferase (InterPro:IPR000374), Phosphatidate cytidylyltransferase, eukaryota (InterPro:IPR016720); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CDP-diacylglycerol synthase 1 (TAIR:AT1G62430.1); Has 7211 Blast hits to 7203 proteins in 2581 species: Archae - 0; Bacteria - 5077; Metazoa - 186; Fungi - 148; Plants - 138; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1662 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:13482580..13484697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54927.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 471 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMEKDLSPN SPRIRKLRDT SYPTTPTSRM NTNNQRDNHY PNIPNSPRDY NYTPSSPTAR IRHRRRSSEN LAEVNRSNVS RVSNLLLGDK NKYRSMWIRT 101: CSSLWMLGGV VFIIYMGHLY IWAMVVVIQI FMAKELFFLR RRAHEERRLP GFWLLNWHFF FTAMLFVYGR IIQQQLVNTV SSDRFIYKLV SGLIKYQMVI 201: CYFLYIAGLI WFILTLKNKM YKYQFGQYAW THMILIVVFT QSSFTVANIF EGIFWFLLPA ALIAMNDVAA YFFGFYFGKT PLIKLSPKKT WEGFIGASVA 301: TIISAFIFAN VLGQFQWLTC PRKDLSTGWL HCDPGPLFRP EYYPFPSWIT PFSPWKGIST LPVQWHAFSL GLFASIMAPF GGFFASGFKR AFKIKDFGDS 401: IPGHGGFTDR MDCQMVMAVF AYIYIQSFIV NRDYSVEMIL DQISRSLGHE EQKMLYEKLG DILQHKLQGR F |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)