AT2G37330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.568 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aluminum sensitive 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an ABC transporter-like protein, without an ATPase domain, required for aluminum (Al) resistance/tolerance and may function to redistribute accumulated Al away from sensitive tissues in order to protect the growing root from the toxic effects of Al. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ALUMINUM SENSITIVE 3 (ALS3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Conserved hypothetical protein CHP00245 (InterPro:IPR005226); Has 1906 Blast hits to 1906 proteins in 934 species: Archae - 39; Bacteria - 1722; Metazoa - 0; Fungi - 12; Plants - 43; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 90 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:15669190..15670172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29889.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 273 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDLKWDDFFN DYEWLIVFLK GMVKPAAALV VVLLAVILSY SQNLSLEGEM IYSVSRSFLQ LSVIGFVLQF IFNQENSGWI ILAYLFMVSV AGYTAGQRAR 101: HVPRGKYVAG LSILAGTSIT MFLLVLLNVF PFTPRYMIPI AGMLVGNAMT VTGVTMKQLR DDIKMQLNLV ETALALGATP RQATLQQVKR ALVISLSPVL 201: DSCKTVGLIS LPGAMTGMIM GGASPLEAIQ LQIVVMNMMV GAATVSSITS TYLCWPSFFT KAYQLQTHVF SSD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)