AT4G20070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : allantoate amidohydrolase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
The gene encoding Arabidopsis thaliana Allantoate Amidohydrolase (AtAAH)which catalyzes the allantoate deiminase reaction (EC 3.5.3.9)is expressed in all parts of the plant being consistent with a function in purine turnover in Arabidopsis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
allantoate amidohydrolase (AAH); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M20 (InterPro:IPR002933), ArgE/DapE/ACY1/CPG2/YscS, conserved site (InterPro:IPR001261), Amidase, hydantoinase/carbamoylase (InterPro:IPR010158), Peptidase M20, dimerisation (InterPro:IPR011650); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ureidoglycolate amidohydrolase (TAIR:AT5G43600.1); Has 3541 Blast hits to 3529 proteins in 962 species: Archae - 54; Bacteria - 2502; Metazoa - 32; Fungi - 158; Plants - 88; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 707 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:10861548..10864529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56527.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 525 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVPHPSSSS SRSHPFLSHV YHTSFHHHHH HNHPSLVLFW CLVFSLLSPL ALSSSSSSSS SSSDSSSSSS SHISLGIGET EGTKHDLHQA ILRDEAVARL 101: HELGQVSDAA THLERTFMSP ASIRAIPLIR GWMEDAGLST WVDYMGNVHG RVEPKNGSSQ ALLIGSHMDT VIDAGKYDGS LGIISAISAL KVLKIDGRLG 201: ELKRPVEVIA FSDEEGVRFQ STFLGSAALA GIMPVSRLEV TDKSGISVQD ALKENSIDIT DENLMQLKYD PASVWGYVEV HIEQGPVLEW VGYPLGVVKG 301: IAGQTRLKVT VKGSQGHAGT VPMSMRQDPM TGAAELIVLL ESVCKNPKDY LSCNVQCNED TVESLANSLV CTVGEISTWP SASNVIPGQV TFTVDLRTID 401: DVGRKAILHD LSTRMYQICD KRSLLCSIER KHDADAVMSD PQLSLQLKSA AQSALKKMTG EVQDEVPVLM SGAGHDAMAM AHLTKVGMLF VRCRGGISHS 501: PAEHVLDDDV GAAGLAILEF LESQM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)