AT3G42640.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : H(+)-ATPase 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
H(+)-ATPase 8 (HA8); FUNCTIONS IN: ATPase activity; INVOLVED IN: cation transport, metabolic process, ATP biosynthetic process; LOCATED IN: plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, P-type, ATPase-associated domain (InterPro:IPR008250), ATPase, P-type cation-transporter, N-terminal (InterPro:IPR004014), Haloacid dehalogenase-like hydrolase (InterPro:IPR005834), ATPase, P-type, H+ transporting proton pump (InterPro:IPR000695), ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter (InterPro:IPR001757), ATPase, P-type, plasma-membrane proton-efflux (InterPro:IPR006534), ATPase, P-type phosphorylation site (InterPro:IPR018303); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: H(+)-ATPase 6 (TAIR:AT2G07560.1); Has 37108 Blast hits to 32939 proteins in 3205 species: Archae - 721; Bacteria - 23855; Metazoa - 3927; Fungi - 2384; Plants - 1873; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 4345 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:14724309..14728062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 104137.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 948 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATEFSWDEI KKENVDLERI PVEEVFEQLK CSKEGLSSDE GAKRLEIFGA NKLEEKSENK FLKFLGFMWN PLSWVMESAA IMAIVLANGG GKAPDWQDFI 101: GIMVLLIINS TISFIEENNA GNAAAALMAN LAPKTKVLRD GKWGEQEASI LVPGDLISIK LGDIVPADAR LLEGDPLKID QSALTGESLP TTKHPGDEVF 201: SGSTCKQGEI EAVVIATGVH TFFGKAAHLV DSTNNVGHFQ KVLTSIGNFC ICSIGLGMLI EILIMYPIQH RTYRDGIDNL LVLLIGGIPI AMPTVLSVTM 301: AIGSHRLSQQ GAITKRMTAI EEMAGMDVLC SDKTGTLTLN KLSVDKSLIE VFPKNMDSDS VVLMAARASR IENQDAIDAS IVGMLGDPKE ARAGITEVHF 401: LPFNPVDKRT AITYIDESGD WHRSSKGAPE QIIELCNLQG ETKRKAHEVI DGFAERGLRS LGVAQQTVPE KTKESDGSPW EFVGLLPLFD PPRHDSAETI 501: RRALELGVNV KMITGDQLAI GIETGRRLGM GTNMYPSTSL LGNSKDESLV GIPIDELIEK ADGFAGVFPE HKYEIVKKLQ ERKHICGMTG DGVNDAPALK 601: KADIGIAVAD ATDAARSASD IVLTEPGLSV IISAVLTSRA IFQRMKNYTI YAVSITIRIV LGFMLVALIW RFDFAPFMVL IIAILNDGTI MTISKDRVKP 701: SPVPDSWKLN EIFATGVVLG TYMALTTVLF FWLAHDTDFF SKTFGVRSIQ GNEEELMAAL YLQVSIISQA LIFVTRSRSW SFVERPGFLL LIAFVIAQLV 801: ATLIAVYANW GFARIVGCGW GWAGGIWVYS IITYIPLDIL KFIIRYALTG KAWDNMINQK TAFTTKKDYG KGEREAQWAL AQRTLHGLPP PEAMFNDNKN 901: ELSEIAEQAK RRAEVARLRE LHTLKGHVES VVKLKGLDID TIQQHYTV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)