AT2G41210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 plasma membrane 0.500 ASURE: cytosol,plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphatidylinositol- 4-phosphate 5-kinase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase activity that plays a role in pollen tip growth. The enzyme localizes to the apical plasma membrane and adjacent cytosolic region of pollen tubes. Overexpression of this gene leads to increased deposition of pectin in the cell wall at the tip of the pollen tube and causes altered pollen tube morphology. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phosphatidylinositol- 4-phosphate 5-kinase 5 (PIP5K5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, core, subgroup (InterPro:IPR016034), Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, plant (InterPro:IPR017163), MORN motif (InterPro:IPR003409), Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, core (InterPro:IPR002498); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphatidyl inositol monophosphate 5 kinase 4 (TAIR:AT3G56960.1); Has 28370 Blast hits to 7831 proteins in 606 species: Archae - 2; Bacteria - 4383; Metazoa - 4412; Fungi - 450; Plants - 2408; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 16713 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:17173627..17176575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 88208.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 772 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSKDQSYVLK AWEVTVRKTQ QAKKRANSVF GTVSVAPHTD NDTTTDDNDD ETTTNRSSLE EFYHAERVLP NGDYYTGQWY DSFPHGHGKY LWTDGCMYIG 101: DWYNGKTMGN GKFGWPSGAT YEGEFKSGYM DGIGTYTGPS GDAYKGQWVM NLKHGHGVKS FANGDAYDGE WRRGLQEGQG KYQWSDGSYY IGEWKNGTIC 201: GKGSFVWTNG NRYDGFWDEG FPRGNGTFKW DNGSFYVGHW SKDPEEMNGT YYPSGNEGNL EWDPKDLFNN LSEYTICSGE RVPTLPSQKK LSVWNSSKRI 301: EKPRRTSVDG RVSVGVDRAF EKMNMWGNEI GEGGADMRKE LDAELMRLDA EGLQSLKSSP VPMKLPKAGR KQGETISKGH RNYELMLNLQ LGIRHSVGRQ 401: APAASLDLKP SAFDPKDKIW RRFPREGTKY TPPHQSTEFK WKDYCPLVFR SLRKLFKVDP ADYMLSICGN DALRELSSPG KSGSFFYLTN DDRYMIKTMK 501: KSETKVLLGM LAAYYNHVRA FENSLVIRFF GLHCVKLNGP TQKKVRFVIM GNLFCSKYSV HRRFDLKGSS LGRTTDKPES EIDSNTILKD LDLNFIFRLQ 601: KAWYQEFIRQ IDKDCEFLEQ ERIMDYSLLV GIHFREASVA GELIPSGART PIGESEEESG PRLSRAEVDE LLSDPSRWAS IRLGTNMPAR AERTMRKNDS 701: ELQLVGEPTG EFYEVVMIFG IIDILQDYDI SKKLEHAYKS IQYDPSSISA VDPRQYSRRF RDFIFKVFTD DN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)