AT2G03620.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 0.971 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : magnesium transporter 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Transmembrane magnesium transporter. One of nine family members. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
magnesium transporter 3 (MGT3); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: magnesium transporter 2 (TAIR:AT1G16010.3); Has 780 Blast hits to 741 proteins in 158 species: Archae - 0; Bacteria - 6; Metazoa - 65; Fungi - 215; Plants - 401; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 93 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:-:1100489..1102168 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 47037.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 4.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 421 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGEQLDPFSA SNLPDFISSQ KIGRPVNFEG QTNRGHPFSG LKKRGQSSRS WVKIDQDGNS AVLELDKATI MKRCSLPSRD LRLLDPLFIY PSSILGRERA 101: IVVSLEKIRC IITAEEVILM NARDASVVQY QSELCKRLQS NHNLNVKDDL PFEFKALELV LELSCLSLDA QVNELEMEVY PVLDELATNI STLNLEHVRR 201: LKGRLLTLTQ KVQKVCDEIE HLMDDDDDMA EMYLTEKKER AEAHASEELE DNIGEDFESS GIVSKSAPVS PVGSTSGNFG KLQRAFSSIV GSHKSLLSSS 301: SIGENIDQLE MLLEAYFVVV DNTLSKLSSL KEYIDDTEDL INIKLGNVQN QLIQFQLLLT AATFVAAIFA AVTAVFGMNL QDSVFQNPTT FQYVLLITGI 401: GCGFLYFGFV LYFKHKKVFP L |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)