AT5G09690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.995 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : magnesium transporter 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Transmembrane magnesium transporter. One of nine family members. Loss of function mutants exhibit poor growth under magnesium stress conditions. Splice variant AT5G09690.1 (386 aa) is a functional transporter while AT5G09690.4 (371 aa) does not have transporter activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
magnesium transporter 7 (MGT7); FUNCTIONS IN: magnesium ion transmembrane transporter activity, metal ion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: metal ion transport, transmembrane transport; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 31 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mg2+ transporter protein, CorA-like (InterPro:IPR002523); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: magnesium transporter 9 (TAIR:AT5G64560.1); Has 779 Blast hits to 766 proteins in 170 species: Archae - 0; Bacteria - 21; Metazoa - 61; Fungi - 196; Plants - 399; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 102 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:3000990..3003169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43433.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 386 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSPDGELVPV DSSAVVTAKR KTSQLSRSWI SIDATGQKTV LDVDKHVIMH RVQIHARDLR ILDPNLFYPS AILGRERAIV LNLEHIKAII TAEEVLIRDS 101: SDENVIPVLE EFQRRLPVGN EAHGVHGDGD LGEEDESPFE FRALEVALEA ICSFLAARTT ELEKFAYPAL DELTLKISSR NLERVRKLKS AMTRLTARVQ 201: KVRDELEQLL DDDGDMADLY LTRKLVGASS SVSVSDEPIW YPTSPTIGSM ISRASRVSLV TVRGDDETDV EELEMLLEAY FMQIDSTLNK LTELREYIDD 301: TEDYINIQLD NHRNQLIQLE LMLSAGTVCV SVYSMIAGIF GMNIPNTWNH DHGYIFKWVV SLTGTFCIVL FVIILSYARF RGLIGS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)