AT1G51500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ABC-2 type transporter family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an ABC transporter involved in cuticular wax biosynthesis. Lines carrying recessive mutations in this locus have weakly glaucous stem surface, and relative elevated secondary alcohols and ketones. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ECERIFERUM 5 (CER5); FUNCTIONS IN: ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances; INVOLVED IN: wax biosynthetic process; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ABC transporter-like (InterPro:IPR003439), ABC-2 type transporter (InterPro:IPR013525), ABC transporter, conserved site (InterPro:IPR017871); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ABC-2 type transporter family protein (TAIR:AT3G21090.1); Has 373832 Blast hits to 343583 proteins in 4060 species: Archae - 6936; Bacteria - 298137; Metazoa - 8223; Fungi - 6589; Plants - 5451; Viruses - 9; Other Eukaryotes - 48487 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:19097967..19100972 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 76455.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 687 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELESTSNGR RPPPPAEIGR GAYLAWEDLT VVIPNFSGGP TRRLLDGLNG HAEPGRIMAI MGPSGSGKST LLDSLAGRLA RNVIMTGNLL LNGKKARLDY 101: GLVAYVTQED ILMGTLTVRE TITYSAHLRL SSDLTKEEVN DIVEGTIIEL GLQDCADRVI GNWHSRGVSG GERKRVSVAL EILTRPQILF LDEPTSGLDS 201: ASAFFVIQAL RNIARDGGRT VVSSIHQPSS EVFALFDDLF LLSSGETVYF GESKFAVEFF AEAGFPCPKK RNPSDHFLRC INSDFDTVTA TLKGSQRIRE 301: TPATSDPLMN LATSEIKARL VENYRRSVYA KSAKSRIREL ASIEGHHGME VRKGSEATWF KQLRTLTKRS FVNMCRDIGY YWSRIVIYIV VSFCVGTIFY 401: DVGHSYTSIL ARVSCGGFIT GFMTFMSIGG FPSFIEEMKV FYKERLSGYY GVSVYIISNY VSSFPFLVAI ALITGSITYN MVKFRPGVSH WAFFCLNIFF 501: SVSVIESLMM VVASLVPNFL MGLITGAGII GIIMMTSGFF RLLPDLPKVF WRYPISFMSY GSWAIQGAYK NDFLGLEFDP MFAGEPKMTG EQVINKIFGV 601: QVTHSKWWDL SAIVLILVCY RILFFIVLKL KERAEPALKA IQAKRTMKSL KKRPSFKKVP SLSSLSSRRH QPLHSLSSQE GLTSPIN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)