AT2G29650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphate transporter 4;1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an inorganic phosphate transporter (PHT4;1) that is localized to the thylakoid membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phosphate transporter 4;1 (PHT4;1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), Major facilitator superfamily MFS-1 (InterPro:IPR011701), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Major facilitator superfamily protein (TAIR:AT4G00370.1); Has 36081 Blast hits to 35982 proteins in 2442 species: Archae - 467; Bacteria - 29522; Metazoa - 2463; Fungi - 1237; Plants - 437; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1955 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:12673685..12676003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56501.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 512 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNARALLCSS NIHSLYTSNR PPEKTSSSRS LRNLKPSPKS LRVWIYPRNR SSVFRVLVRS SDKSESSNSY YVEGDKVSGN NDVVSDSPSS IVLPWWEEFP 101: KRWVIVLLCF SAFLLCNMDR VNMSIAILPM SAEYGWNPAT VGLIQSSFFW GYLLTQIAGG IWADTVGGKR VLGFGVIWWS IATILTPVAA KLGLPYLLVV 201: RAFMGVGEGV AMPAMNNILS KWVPVQERSR SLALVYSGMY LGSVTGLAFS PFLIHQFGWP SVFYSFGSLG TVWLTLWLTK AESSPLEDPT LLPEERKLIA 301: DNCASKEPVK SIPWRLILSK PPVWALISCH FCHNWGTFIL LTWMPTYYHQ VLKFNLMESG LLSVFPWMTM AISANAGGWI ADTLVSRGFS VTNVRKIMQT 401: IGFLGPAFFL TQLKHIDSPT MAVLCMACSQ GTDAFSQSGL YSNHQDIAPR YSGVLLGLSN TAGVLAGVLG TAATGHILQH GSWDDVFTIS VGLYLVGTVI 501: WNLFSTGEKI ID |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)