AT1G69120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : K-box region and MADS-box transcription factor family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Floral homeotic gene encoding a MADS domain protein homologous to SRF transcription factors. Specifies floral meristem and sepal identity. Required for the transcriptional activation of AGAMOUS. Interacts with LEAFY.Binds to promoter and regulates the expression of flowering time genes SVP, SOC1 and AGL24. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
APETALA1 (AP1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Transcription factor, MADS-box (InterPro:IPR002100), Transcription factor, K-box (InterPro:IPR002487); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: K-box region and MADS-box transcription factor family protein (TAIR:AT1G26310.1); Has 8031 Blast hits to 8015 proteins in 981 species: Archae - 10; Bacteria - 56; Metazoa - 785; Fungi - 329; Plants - 6623; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 226 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:25982576..25986102 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30184.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 256 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGRGRVQLKR IENKINRQVT FSKRRAGLLK KAHEISVLCD AEVALVVFSH KGKLFEYSTD SCMEKILERY ERYSYAERQL IAPESDVNTN WSMEYNRLKA 101: KIELLERNQR HYLGEDLQAM SPKELQNLEQ QLDTALKHIR TRKNQLMYES INELQKKEKA IQEQNSMLSK QIKEREKILR AQQEQWDQQN QGHNMPPPLP 201: PQQHQIQHPY MLSHQPSPFL NMGGLYQEDD PMAMRRNDLE LTLEPVYNCN LGCFAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)