AT1G51820.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 10 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT1G51850.1); Has 160279 Blast hits to 119957 proteins in 4419 species: Archae - 101; Bacteria - 13381; Metazoa - 43768; Fungi - 9630; Plants - 74708; Viruses - 404; Other Eukaryotes - 18287 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:19237407..19241883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 98103.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 885 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MERHFVFIAT YLLIFHLVQA QNQTGFISVD CGLSLLESPY DAPQTGLTYT SDADLVASGK TGRLAKEFEP LVDKPTLTLR YFPEGVRNCY NLNVTSDTNY 101: LIKATFVYGN YDGLNVGPNF NLYLGPNLWT TVSSNDTIEE IILVTRSNSL QVCLVKTGIS IPFINMLELR PMKKNMYVTQ SGSLKYLFRG YISNSSTRIR 201: FPDDVYDRKW YPLFDDSWTQ VTTNLKVNTS ITYELPQSVM AKAATPIKAN DTLNITWTVE PPTTQFYSYV HIAEIQALRA NETREFNVTL NGEYTFGPFS 301: PIPLKTASIV DLSPGQCDGG RCILQVVKTL KSTLPPLLNA IEAFTVIDFP QMETNENDVA GIKNVQGTYG LSRISWQGDP CVPKQLLWDG LNCKNSDIST 401: PPIITSLDLS SSGLTGIITQ AIKNLTHLQI LDLSDNNLTG EVPEFLADIK SLLVINLSGN NLSGSVPPSL LQKKGMKLNV EGNPHILCTT GSCVKKKEDG 501: HKKKSVIVPV VASIASIAVL IGALVLFLIL RKKRSPKVEG PPPSYMQASD GRLPRSSEPA IVTKNRRFSY SQVVIMTNNF QRILGKGGFG MVYHGFVNGT 601: EQVAVKILSH SSSQGYKQFK AEVELLLRVH HKNLVGLVGY CDEGDNLALI YEYMANGDLK EHMSGTRNRF ILNWGTRLKI VIESAQGLEY LHNGCKPPMV 701: HRDVKTTNIL LNEHFEAKLA DFGLSRSFLI EGETHVSTVV AGTPGYLDPE YHRTNWLTEK SDVYSFGILL LEIITNRHVI DQSREKPHIG EWVGVMLTKG 801: DIQSIMDPSL NEDYDSGSVW KAVELAMSCL NHSSARRPTM SQVVIELNEC LASENARGGA SRDMESKSSI EVSLTFGTEV SPNAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)