AT2G37170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : plasma membrane intrinsic protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
a member of the plasma membrane intrinsic protein subfamily PIP2. localizes to the plasma membrane and exhibits water transport activity in Xenopus oocyte. expressed specifically in the vascular bundles and protein level increases slightly during leaf dev | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
plasma membrane intrinsic protein 2 (PIP2B); FUNCTIONS IN: water channel activity; INVOLVED IN: response to water deprivation, response to salt stress, transport, water transport; LOCATED IN: plasma membrane, chloroplast, membrane; EXPRESSED IN: root, cultured cell, callus; EXPRESSED DURING: seedling growth; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Major intrinsic protein, conserved site (InterPro:IPR022357), Aquaporin (InterPro:IPR012269), Major intrinsic protein (InterPro:IPR000425); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Aquaporin-like superfamily protein (TAIR:AT2G37180.1); Has 10851 Blast hits to 10838 proteins in 2234 species: Archae - 81; Bacteria - 5194; Metazoa - 1467; Fungi - 455; Plants - 2519; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1133 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15613624..15614791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30454.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 285 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKDVEGPEG FQTRDYEDPP PTPFFDADEL TKWSLYRAVI AEFVATLLFL YITVLTVIGY KIQSDTKAGG VDCGGVGILG IAWAFGGMIF ILVYCTAGIS 101: GGHINPAVTF GLFLARKVSL IRAVLYMVAQ CLGAICGVGF VKAFQSSYYD RYGGGANSLA DGYNTGTGLA AEIIGTFVLV YTVFSATDPK RNARDSHVPV 201: LAPLPIGFAV FMVHLATIPI TGTGINPARS FGAAVIYNKS KPWDDHWIFW VGPFIGAAIA AFYHQFVLRA SGSKSLGSFR SAANV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)