AT1G75410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : BEL1-like homeodomain 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
BEL1-like homeodomain 3 (BLH3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BEL1-like homeodomain 3 (BLH3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Homeobox (InterPro:IPR001356), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), POX (InterPro:IPR006563), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: BEL1-like homeodomain 10 (TAIR:AT1G19700.3); Has 5228 Blast hits to 5212 proteins in 344 species: Archae - 0; Bacteria - 24; Metazoa - 2027; Fungi - 328; Plants - 2469; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 380 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28300095..28301890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59682.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 524 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVYYPNSVG MQSLYQESIY LNEQQQQQQQ ASSSSAASFS EIVSGDVRNN EMVFIPPTSD VAVNGNVTVS SNDLSFHGGG LSLSLGNQIQ SAVSVSPFQY 101: HYQNLSNQLS YNNLNPSTMS DENGKSLSVH QHHSDQILPS SVYNNNGNNG VGFYNNYRYE TSGFVSSVLR SRYLKPTQQL LDEVVSVRKD LKLGNKKMKN 201: DKGQDFHNGS SDNITEDDKS QSQELSPSER QELQSKKSKL LTMVDEVDKR YNQYHHQMEA LASSFEMVTG LGAAKPYTSV ALNRISRHFR CLRDAIKEQI 301: QVIRGKLGER ETSDEQGERI PRLRYLDQRL RQQRALHQQL GMVRPAWRPQ RGLPENSVSI LRAWLFEHFL HPYPKESEKI MLSKQTGLSK NQVANWFINA 401: RVRLWKPMIE EMYKEEFGES AELLSNSNQD TKKMQETSQL KHEDSSSSQQ QNQGNNNNNI PYTSDAEQNL VFADPKPDRA TTGDYDSLMN YHGFGIDDYN 501: RYVGLGNQQD GRYSNPHQLH DFVV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)