AT2G30400.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ovate family protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ovate family protein 2 (OFP2); INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF623 (InterPro:IPR006458); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ovate family protein 4 (TAIR:AT1G06920.1); Has 501 Blast hits to 493 proteins in 50 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 28; Fungi - 6; Plants - 431; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 34 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12956592..12957554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36789.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 320 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNYKFRISE MLPNAWFHKL KDVTKHSKPK NKASSSSSNT CSKKKPSSDS LPQHSYFSNS LVANNPPHHN SPRNSLHTKK MSKRKTLYKP SLKPLTPPPL 101: LVSASFNKSK INDQDSSYSL FPAIETSPES FVYSFYEEDD DDEFVEFSNF KINTKNKAFT KQKVKVIDSV EKACTASKPI KKPQKSHLSV KISRDEDDNE 201: YKAEKKYQRQ VSSGRKPSAG INLKRVNSPR IQLSGTRRST SRRSESKQDV LESFAVMKRS VDPKKDFRES MIEMIEENNI RASKDLEDLL ACYLTLNPKE 301: YHDLIIHVFE QIWLQLTKTK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)