AT4G34610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : BEL1-like homeodomain 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
BEL1-like homeodomain 6 (BLH6); FUNCTIONS IN: DNA binding, sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: regulation of transcription, DNA-dependent, regulation of transcription; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Homeobox (InterPro:IPR001356), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), POX (InterPro:IPR006563), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: BEL1-like homeodomain 7 (TAIR:AT2G16400.1); Has 4819 Blast hits to 4819 proteins in 327 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 1855; Fungi - 314; Plants - 2477; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 171 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:16530546..16532498 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59612.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 532 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENYPETQFI PGDSMIQNAI VSYSEESAGR ERRTEANNVS ASQERQALSR FGGVPQMQNI GQDFGSWRDQ ASDRNGFQLM SAMAGATGIL QTGQGLSLSL 101: GSQILPGIHQ ISHQNMAPRG NEYATQSFPG GNQNLDVVRT IPNSKYLKAA QQLLDEAVNV KKALKQFQAE GDKNNENPQE PNQSTQDSST NPPADISQSE 201: RQEMQSKLTK LLSMLDEVDR RYKQYYQQMQ IVVSSFDVIA GYGAAKPYTA LALQTISRHF RSLRDAISGQ ILVLRKCLGE QQDGSDGKRV GIISRLKYVD 301: QHLRQQRGFM QPQAWRPQRG LPENSVLILR AWLFEHFLHP YPKDSDKIML ARQTGLSRGQ VSNWFINARV RLWKPMVEEI YKEEFTENDS NSSSENTPKM 401: SEIGPVAADD EDRAREFSQD QTKPDHGHGY GEETRGMVQG SHMDGRRFMA VEPTYHVADT SRLGRGDVSL TLGLQNSQGQ DNVVAMSSEA YNNFSGVDIY 501: ENAIPGDEME YVNPGSRQNR INSSQLVHDF VA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)