AT3G53810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Legume lectin, beta chain (InterPro:IPR001220), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: receptor lectin kinase (TAIR:AT2G37710.1); Has 115173 Blast hits to 113727 proteins in 4497 species: Archae - 97; Bacteria - 13623; Metazoa - 41795; Fungi - 9670; Plants - 33434; Viruses - 433; Other Eukaryotes - 16121 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19933153..19935186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 75982.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 677 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFVKLKLIFF FFLLCQIMIS SSQNLNFTYN GFHPPLTDIS LQGLATVTPN GLLKLTNTSV QKTGHAFCTE RIRFKDSQNG NVSSFSTTFV FAIHSQIPTL 101: SGHGIAFVVA PTLGLPFALP SQYIGLFNIS NNGNDTNHIF AVEFDTIQSS EFGDPNDNHV GIDLNGLRSA NYSTAGYRDD HDKFQNLSLI SRKRIQVWID 201: YDNRSHRIDV TVAPFDSDKP RKPLVSYVRD LSSILLEDMY VGFSSATGSV LSEHFLVGWS FRLNGEAPML SLSKLPKLPR FEPRRISEFY KIGMPLISLS 301: LIFSIIFLAF YIVRRKKKYE EELDDWETEF GKNRFRFKEL YHATKGFKEK DLLGSGGFGR VYRGILPTTK LEVAVKRVSH DSKQGMKEFV AEIVSIGRMS 401: HRNLVPLLGY CRRRGELLLV YDYMPNGSLD KYLYNNPETT LDWKQRSTII KGVASGLFYL HEEWEQVVIH RDVKASNVLL DADFNGRLGD FGLARLYDHG 501: SDPQTTHVVG TLGYLAPEHS RTGRATTTTD VYAFGAFLLE VVSGRRPIEF HSASDDTFLL VEWVFSLWLR GNIMEAKDPK LGSSGYDLEE VEMVLKLGLL 601: CSHSDPRARP SMRQVLQYLR GDMALPELTP LDLSAGSVMN LGGRDGFSGI AMTDFSTVFK GFTGGSSIAD SLLSGGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)