AT4G02410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Legume lectin, beta chain (InterPro:IPR001220), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985), Legume lectin, beta chain, Mn/Ca-binding site (InterPro:IPR019825); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein (TAIR:AT4G02420.1); Has 115275 Blast hits to 113889 proteins in 4562 species: Archae - 89; Bacteria - 12949; Metazoa - 42488; Fungi - 9587; Plants - 33653; Viruses - 400; Other Eukaryotes - 16109 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:1060086..1062110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 75927.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 674 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFFKLFTIFF FFIILLSKPL NSSSQSLNFT YNSFHRPPTN ISIQGIATVT SNGILKLTDK TVISTGHAFY TEPIRFKDSP NDTVSSFSTT FVIGIYSGIP 101: TISGHGMAFF IAPNPVLSSA MASQYLGLFS STNNGNDTNH ILAVEFDTIM NPEFDDTNDN HVGININSLT SVKSSLVGYW DEINQFNNLT LISRKRMQVW 201: VDYDDRTNQI DVTMAPFGEV KPRKALVSVV RDLSSVFLQD MYLGFSAATG YVLSEHFVFG WSFMVKGKTA PPLTLSKVPK FPRVGPTSLQ RFYKNRMPLF 301: SLLLIPVLFV VSLIFLVRFI VRRRRKFAEE FEDWETEFGK NRLRFKDLYY ATKGFKDKDL LGSGGFGRVY RGVMPTTKKE IAVKRVSNES RQGLKEFVAE 401: IVSIGRMSHR NLVPLLGYCR RRDELLLVYD YMPNGSLDKY LYDCPEVTLD WKQRFNVIIG VASGLFYLHE EWEQVVIHRD IKASNVLLDA EYNGRLGDFG 501: LARLCDHGSD PQTTRVVGTW GYLAPDHVRT GRATTATDVF AFGVLLLEVA CGRRPIEIEI ESDESVLLVD SVFGFWIEGN ILDATDPNLG SVYDQREVET 601: VLKLGLLCSH SDPQVRPTMR QVLQYLRGDA TLPDLSPLDF RGSGKMLGMN HRFSESCTFS SGSSIAYSIV SGGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)