AT3G22840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Chlorophyll A-B binding family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an early light-inducible protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
EARLY LIGHT-INDUCABLE PROTEIN (ELIP1); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Chlorophyll A-B binding family protein (TAIR:AT4G14690.1); Has 319 Blast hits to 319 proteins in 50 species: Archae - 0; Bacteria - 5; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 259; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 55 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:8084628..8085445 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20325.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 195 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATASFNMQS VFAGGLTTRK INTNKLFSAG SFPNLKRNYP VGVRCMAEGG PTNEDSSPAP STSAAQPLPK SPSPPPPMKP KVSTKFSDLL AFSGPAPERI 101: NGRLAMVGFV AALAVELSKG ENVLAQISDG GVSWFLGTTA ILTLASLVPL FKGISVESKS KGIMTSDAEL WNGRFAMLGL VALAFTEFVK GGTLV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)