AT3G51240.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.805 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : flavanone 3-hydroxylase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes flavanone 3-hydroxylase that is coordinately expressed with chalcone synthase and chalcone isomerases. Regulates flavonoid biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
flavanone 3-hydroxylase (F3H); FUNCTIONS IN: naringenin 3-dioxygenase activity; INVOLVED IN: response to UV-B, response to sucrose stimulus, flavonoid biosynthetic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase (InterPro:IPR005123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein (TAIR:AT4G10500.1); Has 8311 Blast hits to 8276 proteins in 982 species: Archae - 0; Bacteria - 1082; Metazoa - 105; Fungi - 917; Plants - 4933; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1274 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19025409..19026658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40277.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 358 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPGTLTELA GESKLNSKFV RDEDERPKVA YNVFSDEIPV ISLAGIDDVD GKRGEICRQI VEACENWGIF QVVDHGVDTN LVADMTRLAR DFFALPPEDK 101: LRFDMSGGKK GGFIVSSHLQ GEAVQDWREI VTYFSYPVRN RDYSRWPDKP EGWVKVTEEY SERLMSLACK LLEVLSEAMG LEKESLTNAC VDMDQKIVVN 201: YYPKCPQPDL TLGLKRHTDP GTITLLLQDQ VGGLQATRDN GKTWITVQPV EGAFVVNLGD HGHFLSNGRF KNADHQAVVN SNSSRLSIAT FQNPAPDATV 301: YPLKVREGEK AILEEPITFA EMYKRKMGRD LELARLKKLA KEERDHKEVD KPVDQIFA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)