AT1G78920.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vacuolar H+-pyrophosphatase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a type II H+-PPases that localizes to and function as a proton pump of the Golgi apparatus in most tissues except for mature leaves. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
vacuolar H+-pyrophosphatase 2 (VP2); FUNCTIONS IN: hydrogen-translocating pyrophosphatase activity; INVOLVED IN: proton transport; LOCATED IN: Golgi apparatus, vacuole; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inorganic H+ pyrophosphatase (InterPro:IPR004131); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Inorganic H pyrophosphatase family protein (TAIR:AT1G16780.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29672340..29676761 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 85137.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 802 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMMDEDVEQA SLMSFNDRPR AFPNMRSKTY SPLIFRIIRK LNVRVLSIIL LFCFGAIFYM GASTSPIIVF VFTVCIISFL LSIYLTKWVL AKDEGPPEMV 101: EISDAIRDGA EGFFRTQYST ISKMAILLAF VILCIYLFRS LTPQQEAAGL GRAMSAYITV AAFLLGALCS GIAGYVGMWV SVRANVRVSS AARRSAREAL 201: QIAVRAGGFS ALVVVGMAVI GIAILYSTFY VWLGVGSPGS MNVTDLPLLL VGYGFGASFV ALFAQLGGGI YTKGADVGAD LVGKVEQGIP EDDPRNPAVI 301: ADLVGDNVGD CAARGADLFE SIAAEIISAM ILGGTMAKKC KIEDPSGFIL FPLVVHSFDL IISSIGILSI KGTRDASVKS PVEDPMAVLQ KGYSLTIILA 401: VITFGASTRW LLYTEQAPSA WFNFALCGLV GIITAYIFVW ISKYYTDYKH EPVRTLALAS STGHGTNIIA GVSLGLESTA LPVLTISVAI ISAYWLGNTS 501: GLVDENGIPT GGLFGTAVAT MGMLSTAAYV LTMDMFGPIA DNAGGIVEMS QQPESVREIT DLLDAVGNTT KATTKGFAIG SAALASFLLF SAYMDEVSAF 601: ANVSFKEVDI AIPEVFVGGL LGAMLIFLFS AWACAAVGRT AQEVVNEVRR QFIERPGIME YKEKPDYSRC VAIVASAALR EMIKPGALAI ASPIVVGLVF 701: RILGYYTGQP LLGAKVVASM LMFATVCGIL MALFLNTAGG AWDNAKKYIE TGALGGKGSE AHKAAVTGDT VGDPFKDTAG PSIHVLIKML ATITLVMAPV 801: FL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)