AT2G43330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : inositol transporter 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a tonoplast-localized myo-inositol exporter, involved in efflux of myo-inositol from the vacuole to the cytosol. The gene is ubiquitously expressed. Reduced root growth in knock-out mutants grown on low inositol agar medium. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
inositol transporter 1 (INT1); FUNCTIONS IN: carbohydrate transmembrane transporter activity, myo-inositol:hydrogen symporter activity, sugar:hydrogen symporter activity; INVOLVED IN: myo-inositol transport; LOCATED IN: plant-type vacuole membrane, vacuole, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: inositol transporter 2 (TAIR:AT1G30220.1); Has 41776 Blast hits to 41190 proteins in 2518 species: Archae - 669; Bacteria - 22523; Metazoa - 5695; Fungi - 8297; Plants - 2788; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1804 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18001135..18003854 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54815.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 509 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTLTIPNAPG SSGYLDMFPE RRMSYFGNSY ILGLTVTAGI GGLLFGYDTG VISGALLYIK DDFEVVKQSS FLQETIVSMA LVGAMIGAAA GGWINDYYGR 101: KKATLFADVV FAAGAIVMAA APDPYVLISG RLLVGLGVGV ASVTAPVYIA EASPSEVRGG LVSTNVLMIT GGQFLSYLVN SAFTQVPGTW RWMLGVSGVP 201: AVIQFILMLF MPESPRWLFM KNRKAEAIQV LARTYDISRL EDEIDHLSAA EEEEKQRKRT VGYLDVFRSK ELRLAFLAGA GLQAFQQFTG INTVMYYSPT 301: IVQMAGFHSN QLALFLSLIV AAMNAAGTVV GIYFIDHCGR KKLALSSLFG VIISLLILSV SFFKQSETSS DGGLYGWLAV LGLALYIVFF APGMGPVPWT 401: VNSEIYPQQY RGICGGMSAT VNWISNLIVA QTFLTIAEAA GTGMTFLILA GIAVLAVIFV IVFVPETQGL TFSEVEQIWK ERAYGNISGW GSSSDSNNME 501: GLLEQGSQS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)