AT2G39290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.500 plastid 0.500 ASURE: mitochondrion,plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphatidylglycerolphosphate synthase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a phosphatidylglycerolphosphate synthase 2C which is dual-targeted into chloroplasts and mitochondria. Mutant plants have mutant chloroplasts but normal mitochondria. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phosphatidylglycerolphosphate synthase 1 (PGP1); FUNCTIONS IN: CDP-alcohol phosphatidyltransferase activity, CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase activity; INVOLVED IN: phosphatidylinositol biosynthetic process, phospholipid biosynthetic process; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase (InterPro:IPR004570), CDP-alcohol phosphatidyltransferase (InterPro:IPR000462); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphatidylglycerolphosphate synthase 2 (TAIR:AT3G55030.1); Has 7695 Blast hits to 7695 proteins in 2371 species: Archae - 0; Bacteria - 5013; Metazoa - 112; Fungi - 127; Plants - 109; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2334 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:16407274..16408840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32160.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 296 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLRSGLASLI VDVNLRRTLR PSPTFSFPAH LSRCIITSRY SSRTSLRFPI QISRHQHRLS YFSSSSSSEQ SRPTSSSRNS FSGHGQLDSD DNSSPPPSQS 101: SSKVLTLPTV LTLGRVAAVP LLVATFYVDS WWGTTATTSI FIAAAITDWL DGYLARKMRL GSAFGAFLDP VADKLMVAAT LILLCTKPIQ VAELGPLPWL 201: LTVPSIAIIG REITMSAVRE WAASQNGKLL EAVAVNNLGK WKTATQMTAL TILLASRDSN VGWLVASGAG LLYVSAGLSV WSLAVYMRKI WKVLMK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)