AT3G57560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : N-acetyl-l-glutamate kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a N-acetylglutamate kinase, involved in arginine biosynthesis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
N-acetyl-l-glutamate kinase (NAGK); FUNCTIONS IN: acetylglutamate kinase activity; INVOLVED IN: arginine biosynthetic process via ornithine, arginine biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: N-acetylglutamate kinase (InterPro:IPR011148), Glutamate 5-kinase (InterPro:IPR001057), Aspartate/glutamate/uridylate kinase (InterPro:IPR001048), Acetylglutamate kinase (InterPro:IPR004662); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: N-acetyl-l-glutamate synthase 2 (TAIR:AT4G37670.2); Has 9387 Blast hits to 9387 proteins in 2227 species: Archae - 281; Bacteria - 6131; Metazoa - 9; Fungi - 140; Plants - 140; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2686 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:21311164..21312207 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36597.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 347 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATVTSNASP KSFSFTVSNP FKTLIPNKSP SLCYPTRNKN HHRLGFSIKA TVSTPPSIAT GNAPSPDYRV EILSESLPFI QKFRGKTIVV KYGGAAMTSP 101: ELKSSVVSDL VLLACVGLRP ILVHGGGPDI NRYLKQLNIP AEFRDGLRVT DATTMEIVSM VLVGKVNKNL VSLINAAGAT AVGLSGHDGR LLTARPVPNS 201: AQLGFVGEVA RVDPSVLRPL VDYGYIPVIA SVAADDSGQA YNINADTVAG ELAAALGAEK LILLTDVAGI LENKEDPSSL IKEIDIKGVK KMIEDGKVAG 301: GMIPKVKCCI RSLAQGVKTA SIIDGRRQHS LLHEIMSDEG AGTMITG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)