AT3G07430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : YGGT family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
YLMG1-1; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: nucleoid organization, chloroplast fission, embryo development ending in seed dormancy; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope, thylakoid membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function YGGT (InterPro:IPR003425); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: YGGT family protein (TAIR:AT4G27990.1); Has 784 Blast hits to 784 proteins in 294 species: Archae - 0; Bacteria - 502; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 124; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 158 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:2379251..2379949 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24923.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 232 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAITALTLR SPVYLPSSAT SPRFHGFTNQ PPPARLFFPL NPFPSLSIQN PKSIRISASA SPITTPILQT EKSTARSSTL TGSTRSLATL AALAIAVTRV 101: LAQKLSLAIQ TSSPVIADGL RFSLSTAGPV FFASLRDRPP GYLNTPLTVV AVGIKKWLDI YSGVLMVRVL LSWFPNIPWE RQPLSAIRDL CDPYLNLFRN 201: IIPPIFDTLD VSPLLAFAVL GTLGSIVHGS TG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)