AT3G56110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : prenylated RAB acceptor 1.B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
prenylated RAB acceptor 1.B1 (PRA1.B1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prenylated rab acceptor PRA1 (InterPro:IPR004895); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: prenylated RAB acceptor 1.B2 (TAIR:AT2G40380.1); Has 577 Blast hits to 577 proteins in 157 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 115; Fungi - 114; Plants - 309; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 39 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:20822228..20822857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22619.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 209 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATPPTLPVT NQQAVQSQPP INTPAFRTFF SRLSTSIRDG LSQRRPWTEL IDRSSMARPE SLTDALSRIR KNLAYFKVNY VAIVSLVLAF SLFSHPLSLL 101: VLIGLLGGWM FLYLFRPSDQ PLVVFGRTFS DRETLLALVL STIVVVFMTS VGSLLTSALM IGVAIVCVHG AFVVPDDLFL DEQEPANAGL LSFLGGSATS 201: AAAAVSGRV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)