AT2G38270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CAX-interacting protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes protein homologous to CXIP1. CXIP1 is a PICOT domain containing protein interacts with CAX1, a high capacity calcium transporter. However, CXP2 does not interact with CAX1 and only moderately activates another calcium transporter CAX4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CAX-interacting protein 2 (CXIP2); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, protein disulfide oxidoreductase activity; INVOLVED IN: cation transport; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutaredoxin (InterPro:IPR002109), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336), Glutaredoxin-related protein (InterPro:IPR004480); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CAX interacting protein 1 (TAIR:AT3G54900.1); Has 5833 Blast hits to 5648 proteins in 1292 species: Archae - 30; Bacteria - 2544; Metazoa - 528; Fungi - 278; Plants - 476; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1977 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:16031347..16033054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32207.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 293 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAITISSSL HASASPRVVR PHVSRNTPVI TLYSRFTPSF SFPSLSFTLR DTAPSRRRSF FIASAVKSLT ETELLPITEA DSIPSASGVY AVYDKSDELQ 101: FVGISRNIAA SVSAHLKSVP ELCGSVKVGI VEEPDKAVLT QAWKLWIEEH IKVTGKVPPG NKSGNNTFVK QTPRKKSDIR LTPGRHVELT VPLEELIDRL 201: VKESKVVAFI KGSRSAPQCG FSQRVVGILE SQGVDYETVD VLDDEYNHGL RETLKNYSNW PTFPQIFVKG ELVGGCDILT SMYENGELAN ILN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)