AT3G21200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : proton gradient regulation 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
proton gradient regulation 7 (PGR7); Has 162 Blast hits to 162 proteins in 45 species: Archae - 0; Bacteria - 40; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 91; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 31 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:7436091..7437845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35465.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 317 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQLQTQSFAL NLLPSPNFAK PIERREFISL KRDPSRPISL RCSVSTTLDT PATASTHKPF PAEVSRSIME LSSVGTLSTL THDGWPLGVG VRFAVDKDGT 101: PVLCLNRSVS PDKRSALHVQ LEQCGLRTPQ CTIQGSIGRP GDDTVLKRLS ATWREKFGEE VKEDSLYVVA VDRVLQMEDF MEDGIWVASS DYKNASPDPL 201: RDIAEDIVNQ INANNMEDIF RFCNVYVDLD FVVSETKMIW MDRLGFDLRV WSPRGVYDVR IPFPMEVTDE KGAKSSFNGM SQLAWEVEKS YCPADFNKVK 301: LLKQVVGSSH SHKGGGQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)