AT3G48730.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase 2 (GSA2); FUNCTIONS IN: glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase activity, pyridoxal phosphate binding, transaminase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: porphyrin biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Aminotransferase class-III (InterPro:IPR005814), Tetrapyrrole biosynthesis, glutamate-1-semialdehyde aminotransferase (InterPro:IPR004639), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase (TAIR:AT5G63570.1); Has 34778 Blast hits to 34772 proteins in 2825 species: Archae - 734; Bacteria - 23568; Metazoa - 533; Fungi - 800; Plants - 388; Viruses - 10; Other Eukaryotes - 8745 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:18049697..18051550 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50144.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 472 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAATLTGSGI ALGFSCSAKF SKRASSSSNR RCIKMSVSVE EKTKKFTLQK SEEAFNAAKN LMPGGVNSPV RAFKSVGGQP VVMDSAKGSR IRDIDGNEYI 101: DYVGSWGPAI IGHADDEVLA ALAETMKKGT SFGAPCLLEN VLAEMVISAV PSIEMVRFVN SGTEACMGVL RLARAFTGKQ KFIKFEGCYH GHANSFLVKA 201: GSGVATLGLP DSPGVPKAAT SDTLTAPYND IAAVEKLFEA NKGEIAAIIL EPVVGNSGFI TPKPEFIEGI RRITKDNGAL LIFDEVMTGF RLAYGGAQEY 301: FGITPDLTTL GKIIGGGLPV GAYGGRRDIM EMVAPAGPMY QAGTLSGNPL AMTAGIHTLK RLSQPGTYEY LDKITKELTN GILEAGKKTG HAMCGGYISG 401: MFGFFFTEGP VYDFSDAKKS DTEKFGKFFR GMLEEGVYLA PSQFEAGFTS LAHTSEDIQF TIAAAEKVLS RL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)