AT4G22550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.987 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphatidic acid phosphatase (PAP2) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phosphatidic acid phosphatase (PAP2) family protein; FUNCTIONS IN: catalytic activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphatidic acid phosphatase/chloroperoxidase, N-terminal (InterPro:IPR016118), Phosphatidic acid phosphatase type 2/haloperoxidase (InterPro:IPR000326); Has 1103 Blast hits to 1103 proteins in 461 species: Archae - 42; Bacteria - 774; Metazoa - 149; Fungi - 11; Plants - 43; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 84 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:11878255..11878896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23389.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 213 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSPSTTTIFI GPILAVDAAV SHAIHTAAKP FLPPFVLLLL EISADFRFSF PVSLSFLLSP PLRSFLVPFL LGLLFDLIFV GIVKLIFRRA RPAYNHPSMS 101: AAVSADHYSF PSGHASRVFF VAASVHFFSA AAEASMTGPS YSFLDGWIRD HNDGDVKVEV VVVVWIWATV TAISRILLGR HYVLDVAAGA FLGIVEALFA 201: LRFLRFDEMI FGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)