AT2G29540.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RNApolymerase 14 kDa subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
RNA polymerase I(A) and III(C) 14 kDa subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
RNApolymerase 14 kDa subunit (RPC14); FUNCTIONS IN: DNA-directed RNA polymerase activity, protein dimerization activity, DNA binding; INVOLVED IN: tRNA transcription; LOCATED IN: DNA-directed RNA polymerase III complex; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-directed RNA polymerase Rpb11, 13-16kDa subunit, conserved site (InterPro:IPR008193), DNA-directed RNA polymerase, dimerisation (InterPro:IPR011261), DNA-directed RNA polymerase, RBP11-like (InterPro:IPR009025); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DNA-directed RNA polymerase, RBP11-like (TAIR:AT3G52090.1); Has 889 Blast hits to 889 proteins in 232 species: Archae - 23; Bacteria - 0; Metazoa - 328; Fungi - 301; Plants - 115; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 122 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12642727..12643828 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14079.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 122 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEHGSFTNVS HASFTLSEED HTLANAVRFV LNQDPRVTVA AYTIPHPSLE QVNIRVQTTG DPAREVFKDA CQELMQMNRH VRSVFDKAVA EYKDEQKRKE 101: EAEEEELKRQ RDLFGSMDIE NN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)