AT5G14040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphate transporter 3;1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phosphate transporter 3;1 (PHT3;1); FUNCTIONS IN: binding; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphate transporter 3;2 (TAIR:AT3G48850.1); Has 17134 Blast hits to 11746 proteins in 429 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 7375; Fungi - 4841; Plants - 3332; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1583 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:4531059..4532965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40091.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 375 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESPKNSLIP SFLYSSSSSP RSFLLDQVLN SNSNAAFEKS PSPAPRSSPT SMISRKNFLI ASPTEPGKGI EMYSPAFYAA CTFGGILSCG LTHMTVTPLD 101: LVKCNMQIDP AKYKSISSGF GILLKEQGVK GFFRGWVPTL LGYSAQGACK FGFYEYFKKT YSDLAGPEYT AKYKTLIYLA GSASAEIIAD IALCPFEAVK 201: VRVQTQPGFA RGMSDGFPKF IKSEGYGGLY KGLAPLWGRQ IPYTMMKFAS FETIVEMIYK YAIPNPKSEC SKGLQLGVSF AGGYVAGVFC AIVSHPADNL 301: VSFLNNAKGA TVGDAVKKIG MVGLFTRGLP LRIVMIGTLT GAQWGLYDAF KVFVGLPTTG GVAPAPAIAA TEAKA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)