AT3G02090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Insulinase (Peptidase family M16) protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
MPPBETA; FUNCTIONS IN: metalloendopeptidase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: in 11 components; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 17 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M16, zinc-binding site (InterPro:IPR001431), Peptidase M16, C-terminal (InterPro:IPR007863), Peptidase M16, N-terminal (InterPro:IPR011765), Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding (InterPro:IPR011249), Peptidase M16, core (InterPro:IPR011237); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Insulinase (Peptidase family M16) protein (TAIR:AT1G51980.1); Has 13314 Blast hits to 12840 proteins in 2395 species: Archae - 22; Bacteria - 8770; Metazoa - 1075; Fungi - 780; Plants - 366; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2298 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:365624..368526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59163.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 531 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMKNLLSLA RRSQRRLFLT QATRSSSSFS AIDSVPASAS PTALSPPPPH LMPYDHAAEI IKNKIKKLEN PDKRFLKYAS PHPILASHNH ILSAPETRVT 101: TLPNGLRVAT ESNLSAKTAT VGVWIDAGSR FESDETNGTA HFLEHMIFKG TDRRTVRALE EEIEDIGGHL NAYTSREQTT YYAKVLDSNV NQALDVLADI 201: LQNSKFEEQR INRERDVILR EMQEVEGQTD EVVLDHLHAT AFQYTPLGRT ILGPAQNVKS ITREDLQNYI KTHYTASRMV IAAAGAVKHE EVVEQVKKLF 301: TKLSSDPTTT SQLVANEPAS FTGSEVRMID DDLPLAQFAV AFEGASWTDP DSVALMVMQT MLGSWNKNVG GGKHVGSDLT QRVAINEIAE SIMAFNTNYK 401: DTGLFGVYAV AKADCLDDLS YAIMYEVTKL AYRVSDADVT RARNQLKSSL LLHMDGTSPI AEDIGRQLLT YGRRIPTAEL FARIDAVDAS TVKRVANKYI 501: YDKDIAISAI GPIQDLPDYN KFRRRTYWNR Y |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)