AT1G51980.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Insulinase (Peptidase family M16) protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Insulinase (Peptidase family M16) protein; FUNCTIONS IN: metalloendopeptidase activity, ATP binding; INVOLVED IN: proteolysis, response to salt stress; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M16, zinc-binding site (InterPro:IPR001431), Peptidase M16, C-terminal (InterPro:IPR007863), Peptidase M16, N-terminal (InterPro:IPR011765), Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding (InterPro:IPR011249), Peptidase M16, core (InterPro:IPR011237); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: mitochondrial processing peptidase alpha subunit (TAIR:AT3G16480.1); Has 6114 Blast hits to 5997 proteins in 1482 species: Archae - 10; Bacteria - 3458; Metazoa - 684; Fungi - 568; Plants - 250; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1141 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:19323692..19326771 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54405.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 503 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYRTAASRAR ALKGVLTRSL RPARYASSSA VAETSSSTPA YLSWLSGGSR AALTSLDMPL QGVSLPPPLA DKVEPSKLQI TTLPNGLKIA SETTPNPAAS 101: IGLYVDCGSI YEAPYFHGAT HLLERMAFKS TLNRTHFRLV REIEAIGGNT SASASREQMS YTIDALKTYV PEMVEVLIDS VRNPAFLDWE VNEELRKMKV 201: EIAELAKNPM GFLLEAIHSA GYSGPLASPL YAPESALDRL NGELLEEFMT ENFTAARMVL AASGVEHEEL LKVAEPLTSD LPNVPPQLAP KSQYVGGDFR 301: QHTGGEATHF AVAFEVPGWN NEKEAVTATV LQMLMGGGGS FSAGGPGKGM HSWLYRRVLN EYQEVQSCTA FTSIFNDTGL FGIYGCSSPQ FAAKAIELAA 401: KELKDVAGGK VNQAHLDRAK AATKSAVLMN LESRMIAAED IGRQILTYGE RKPVDQFLKS VDQLTLKDIA DFTSKVISKP LTMGSFGDVL AVPSYDTISS 501: KFR |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)